O ex-Observatório da Ciência e Ensino Superior (OCES) desenvolveu em conjunto com a Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT) um processo de seleção do primeiro grupo de revistas científicas portuguesas para inclusão no site SciELO Portugal.
Em 2000, o então Observatório da Ciência e Tecnologia (OCT) do Ministério da Ciência e Tecnologia deu os primeiros passos para a criação e desenvolvimento do site SciELO Portugal.